從上面關于增值稅理論稅負的公式來看，雖然會計帳面體現(xiàn)的增值稅交多交少與當期銷項進項的多少比對有關，但從一個較長的期間來看，決定企業(yè)交納增值稅多少的因素有兩個：一是產品的毛利率，增值稅稅負與產品的毛利率正向相關；二是產品的成本結構，也就是產品成本中，材料和可抵扣制造費用及工資成本和不可抵扣制造費用占產品成本的比例構成，當材料及可抵扣制造費用占產品成本的比例大時，也就是工資成本和不可抵扣制造費用占產品成本的比例小時，所交的增值稅就少，反之則所交的增值稅就多，從這個表述來看，材料和可抵扣制造費用是增值稅的抵減因素，產品毛利、工資成本和不可抵扣制造費用是產生增值稅的根本原因。

正因為增值稅的交多交少與產品的毛利率和產品的成本結構相關，故在企業(yè)實務中才有三種關于增值稅偷稅方法，一是虛增材料成本，整體提高材料成本占整過產品成本的比重，既偷增值稅又偷逃企業(yè)所得稅；二是在虛增材料成本的同時，虛減工資及不可抵扣制造費用；三是采取進價加成或售價降低的方法去降低毛利。所以我們在進行審計和稽查作業(yè)時，如果一個企業(yè)的毛利太低，或者是其工人的工資造得比實際工資水平要低得多時，這個企業(yè)很有可能是在帳面動手腳偷增值稅。