1999年至2003年，管委會(huì)作為市政府的派出機(jī)構(gòu)，專(zhuān)門(mén)負(fù)責(zé)區(qū)內(nèi)經(jīng)濟(jì)開(kāi)發(fā)建設(shè)，集中行使市一級(jí)經(jīng)濟(jì)管理權(quán)限，實(shí)行u201c一條龍服務(wù)、一站式管理、一個(gè)窗口對(duì)外u201d。行使外經(jīng)、工商、稅務(wù)、海關(guān)、勞務(wù)、國(guó)土、規(guī)劃等13個(gè)部門(mén)授予的審批和辦理權(quán)，推動(dòng)了工業(yè)園的高速發(fā)展．

2006年8月份起南屏科技工業(yè)園管委會(huì)由香洲區(qū)政府管理，內(nèi)設(shè)辦公室、建設(shè)管理局、經(jīng)濟(jì)發(fā)展局，編制人員10個(gè)。負(fù)責(zé)土地開(kāi)發(fā)、企業(yè)經(jīng)濟(jì)、安全生產(chǎn)等工作。市政設(shè)施管理由市、區(qū)相關(guān)市政單位負(fù)責(zé)，行政審批由市相關(guān)部門(mén)負(fù)責(zé)。